Recherche et exploitation des souches fongiques rhizosphériques dans le bio-contrôle des moisissures phytopathogènes du blé

Abstract

Chaque année, les agents pathogènes causent des pertes agricoles importantes. Le recours aux traitements chimiques représente une menace pour la biodiversité et la santé des consommateurs en raison de leur toxicité. La lutte biologique apparaît ainsi comme une stratégie prometteuse pour la gestion et le contrôle des maladies. L’objectif de notre travail est d’isoler des souches fongiques antagonistes à partir du sol rhizosphérique de trois plantes médicinales (C. cheirifolium L., P. saxatile et I. viscosa L.) et d’évaluer leur potentiel antifongique contre quatre phytopathogènes du blé à l’aide de tests de confrontation directe. Au total, 35 isolats fongiques ont été obtenus et testés pour leur activité chitinolytique. Les souches A. niger (RS2), A. flavus (RS4), A. alliaceus (RS10) et Trichoderma sp. (IV5) se sont révélées les plus performantes et ont été soumises à des tests d’antagonisme contre A. alternata, F. graminearum, F. verticillioides et F. culmorum. Un criblage des activités enzymatiques a également été réalisé. L’évaluation des extraits de chitinases produits par SmF a complété notre étude. Les résultats des tests antifongiques ont montré que tous les isolats testés induisent une inhibition significative de la croissance mycélienne des pathogènes ciblés, avec des taux d’inhibition ≥50%. F. graminearum s’est avéré être le pathogène le plus sensible, présentant des taux d’inhibition supérieurs à 80% pour l’ensemble des isolats testés. Les tests enzymatiques ont révélé une grande diversité d'activités chez A. niger (RS2), A. flavus (RS4) et A. alliaceus (RS10), tandis que Trichoderma sp. (IV5) n’a présenté aucune activité détectable. Toutefois, les extraits bruts de chitinases n’ont exercé aucun effet inhibiteur sur la croissance des phytopathogènes, indiquant que l’antagonisme observé n’est pas exclusivement attribuable à l’activité enzymatique.