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Titre: | Isolement et identification de souches d’Erwinia amylovora, agent du feu bactérien sur poirier dans les wilayas de Bouira et de Boumerdès |
Auteur(s): | DIDANI, Fairouz HEDJERCI, Amina |
Mots-clés: | Erwinia amylovora, feu bactérien, poirier, diagnostic, identification, Bouira, Boumerdès |
Date de publication: | 3-jui-2017 |
Editeur: | Université de Bouira |
Référence bibliographique: | Université de Bouira |
Résumé: | Notre travail a pour but de vérifier la présence de la maladie du feu bactérien dans huit (8) vergers du poirier de la variété Santa Maria au niveau de trois communes dans la wilaya de Bouira (Lakhdaria,M’chedallah et El-Hachimia) et trois autres communes dans la wilaya de Boumerdès (Boudouaou,Corso et Hammedi). Nous avons réalisé un diagnostic symptomatologique sur terrain suivi d’une confirmation au laboratoire après isolement et identification de l’agent causal Erwinia amylovora. Le diagnostic sur terrain a permis de constater la présence de symptômes typiques du feu bactérien sur poirier représentés par la présence de chancres sur le tronc, brulures des bouquets floraux,recourbement des jeunes pousses en crosse, la présence des fruits nécrosés et les gouttelettes d’exsudats riches en bactéries. A partir des vergers d’étude, nous avons collecté 16 échantillons symptomatiques représentatifs sur des bouquets floraux, jeunes fruits nécrosés et d’autres parties végétales contenant l’exsudat bactérien. Les isolements ont été effectués au laboratoire et ont permis d’obtenir un total de 50 isolats bactériens. Les tests d’identifications biochimiques et le test de pathogénicité sur poirette, ont permis de détecter 39 souches comme étant ceux d’Erwinia amylovora. En fin, le suivi sur terrain ainsi que les résultats que nous avons obtenu au laboratoire, nous a permis de dire que la maladie est en cours de propagation permanente surtout que les conditions climatiques sont très favorables dans les régions prospectées. |
Description: | Tables des matières Introduction……………………………………………………………………………….. 1 Chapitre I : Synthèse bibliographique Partie I : Généralités sur la maladie du feu bactérien……………………………………... 3 I-1- Historique et répartition géographique de la maladie………………………………... 3 I-2- Gamme d’hôtes du feu bactérien……………………………………………………... 4 I-3- Présentation du poirier……………………………………………………………….. 5 II-4- Variétés de poire…………………………………………………………………….. 5 I-5- Symptomatologie…………………………………………………………………….. 6 I-6- Cycle biologique de la maladie………………………………………………………. 8 I-7- Impact économique…………………………………………………………………... 10 Partie II : Présentation de la bactérie phytopathogène : Erwinia amylovora……………... 10 II-1- L’agent causal Erwinia amylovora………………………………………………….. 10 II-2- Position systématique……………………………………………………………….. 11 II-3- Les facteurs du pouvoir pathogène………………………………………………….. 12 II-3-1- Le système d’acquisition du fer…………………………………………………… 12 II-3-2- Exopolysaccharides (EPS)………………………………………………………… 12 II-3-3- Le système de sécrétion de type III……………………………………………….. 13 II-4- Épidémiologie de la bactérie phytopathogène………………………………………. 13 II-5- Stratégies de lutte……………………………………………………………………. 14 II-5-1- Mesures prophylactiques………………………………………………………….. 14 II-5-2-Mesures curatives………………………………………………………………….. 15 II-5-2-1- Lutte chimique………………………………………………………………... 15 II-5-2-2- Lutte génétique………………………………………………………………….. 15 II-5-2.3. Lutte biologique…………………………………………………………………. 16 II-5-2.4. Lutte intégrée……………………………………………………………………. 16 Chapitre II : Matériel et méthodes II-1- Présentation des régions d’étude…………………………………………………….. 17 II-1-1- Wilaya de Bouira………………………………………………………………….. 17 II-1-1-1- Commune de Lakhdaria………………………………………………………... 17 II-1-1-2- Commune de M’chedallah……………………………………………………… 17 II-1-1-3- Commune d’El-Hachimia……………………………………………………… 17 II-1-2- Wilaya de Boumerdès……………………………………………………………... 18 II-1-2-1- Commune de Boudouaou………………………………………………………. 18 II-1-2-2- Commune de Corso…………………………………………………………….. 18 II-1-2-3- Commune de Hammedi………………………………………………………… 18 II-2- Présentation des échantillons………………………………………………………... 23 II-3- Diagnostic au laboratoire……………………………………………………………. 25 II-3-1- Isolement et purification…………………………………………………………... 25 II-3-1-1- Isolement………………………………………………………………………... 25 II-3-1-2- Purification……………………………………………………………………… 26 II-3-2- Tests de caractérisation de l’agent pathogène…………………………………….. 26 II-3-2-1- Test de gram…………………………………………………………………….. 26 II-3-2-2- Test d’activité levane sucrase…………………………………………………… 26 II-3-2-3- Test catalase…………………………………………………………………….. 27 II-3-2-4-Test d’activité cytochrome oxydase……………………………………………... 27 II-3-2-5- Fermentation du glucose (oxydation /fermentation)……………………………. 27 II-3-2-6-Test de production d’indole……………………………………………………… 27 II-3-2-7- Test d’utilisation du citrate……………………………………………………… 28 II-3-2-8- Test de fluorescence sur King B……………………………………………….. 28 II-3-2-9-Test de pathogénicité sur poirettes………………………………………………. 28 Chapitre III : Résultats et interprétation III-1- Observation des symptômes sur terrain…………………………………………….. 29 III-2-Résultats du diagnostic au laboratoire………………………………………………. 31 III-2-1- Isolement et obtention des isolats bactériens…………………………………….. 31 III-2-2- Descriptions morphologiques des isolats………………………………………. 31 III-2-3- résultats de tests biochimiques…………………………………………………… 33 III-2-3-1- Test de gram………………………………………………………………….… 33 III-2-3-2- Test d’activité levane sucrase………………………………………………….. 33 III-2-3-3- Test catalase……………………………………………………………………. 34 III-2-3-4- Test d'activité cytochrome oxydase……………………………………………. 34 III-2-3-5- Test oxydation / fermentation………………………………………………….. 35 III-2-3-6- Test production d’indole……………………………………………………….. 35 III-2-3-7- Test d'utilisation du citrate……………………………………………………... 36 III-2-3-8- Test de fluorescence sur King B……………………………………………… 36 III-2-5- résultats du test de pathogénicité sur poirettes…………………………………... Chapitre VI : Discussion 37 VI- Discussion…………………………………………………………………………….. 40 Conclusion et perspectives…………………………………………………………...... 43 Références bibliographiques…………………………………………………………… 45 Annexes |
URI/URL: | http://193.194.80.38:8080/jspui/handle/123456789/2930 |
Collection(s) : | Mémoires Master |
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