La maladie du feu bactérien causée par la bactérie Erwinia amylovora dans la région de Tizi-Ouzou

AMMI, Fatma Zohra Houda

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Title:	La maladie du feu bactérien causée par la bactérie Erwinia amylovora dans la région de Tizi-Ouzou
Authors:	AMMI, Fatma Zohra Houda
Keywords:	feu bactérien, Erwinia amylovora, Rosaceae, Tizi Ouzou, diagnostic
Issue Date:	28-Sep-2017
Publisher:	Université de Bouira
Citation:	Université de Bouira
Abstract:	Le feu bactérien est l'une des maladies les plus destructrices qui attaque les arbres fruitiers à pépins, causé par la bactérie Erwinia amylovora de la famille des Entérobactériaceae. Découverte pour la première fois aux Etats-Unis à la fin du 18 ème siècle, et en Algérie en 2010. L’objectif de ce travail vise à isoler et identifier la bactérie E.amylovora à partir des vergers de poiriers et de pommiers dans la wilaya de Tizi Ouzou durant la période de mois de juin 2017, en réalisant un diagnostic symptomatique sur terrain, suivi d’une série de tests biochimiques et biologiques au laboratoire. Ces tests ont été effectués sur un total de 38 isolats obtenus ayant montré des caractères morphologiques semblables à ceux de la bactérie E.amylovora. Les résultats de l’ensemble de ces tests ont confirmé que parmi ces isolats, 18 souches phytopathogènes ont été identifiées étant Erwinia amylovora. Cette étude a révélé la présence de la bactérie Erwinia amylovora dans la région de Tizi Ouzou qui est en propagation permanente. Pour cela, les autorités doivent déployer toutes les mesures nécessaires pour éradiquer et lutter contre cette maladie Dévastatrice.
Description:	Table des matières Introduction ………………………………………………………………………………... 01 Chapitre I : Données bibliographiques …………………………………………………... 03 I. Erwinia amylovora agent causal de la maladie de feu bactérien ……………… 03 I.1. Taxonomie ……………………………………………………………….……... 03 I.2. Caractéristiques générales ………………………………………………………. 03 I.2.1. Caractéristiques morphologiques ……………………………………... 03 I.2.2. Caractéristiques physiologiques et biochimiques ……………….……. 04 I.3. Les effecteurs de pouvoir pathogène ……………………………………………... 04 I.3.1. Système de sécrétion de type III ………………………………...……. 04 I.3.2. Les exopolysaccharides (EPS) ………………………………..………. 05 I.3.3. Le système d’acquisition du fer ……………………………….……… 06 II. La maladie du feu bactérien …………………………………………………… 07 II.1 Historique et répartition géographique …………………………………..……... 07 II.2 Plantes hôtes …………………………………………………………..………... 07 II.3. Symptômes ……………………………………………………….……………. 09 II.4. Cycle de vie de la maladie ………………………………………………..……. 11 II.5. Facteurs favorables au développement de la maladie ……………………..…... 13 II.6. Gestion de la maladie …………………………………………………..……… 13 II.6.1. Lutte préventive et culturale …………………………………………. 13 II.6.2. Lutte chimique ...................................................................................... 13 II.6.3. Lutte génétique ………………………………………………..……... 14 II.6.4. Lutte biologique …………………………………………..………….. 14 II.6.5. Lutte intégrée ……………………………………………..………….. 15 Chapitre II : Matériel et méthodes ………………………………………………………. 16 II. Présentation de la région d’étude ……………………………………………………... 16 II.1. Répartition géographique ………………………………...……………………. 16 II.2. Climat .................................................................................................................. 16 II.3. Climagramme d’Emberger …………………………………………………….. 17 II.4. Stations d’étude …………………………………………………………..…... 18 II.4.1. Tadmaït …………………………………………………..…………... 18 II.4.2. Draâ Ben Khedda ………………………………………...…………... 19 II.4.3. Tizi Ouzou …………………………………………………….……... 19 II.5. Prélèvement des échantillons sur terrain ………………………………….…… 20 II.6. Traitement des échantillons au laboratoire …………………………………..… 21 II.6.1. Isolement ………………………………………………………..……. 21 II.6.2. Purification …………………………………………………..……….. 21 II.7. Tests d’identification de l’agent pathogène …………………………….……… 21 II.7.1. Tests biochimiques ……………………………………..………….… 21 II.7.1.1. Test de Gram …………………………………………...….. 21 II.7.1.2. Test de mise en évidence de l’activité cytochrome C Oxydase……………………………………………………………… 22 II.7.1.3. Test de mise en évidence du métabolisme oxydatif/ fermentatif du glucose ……………………..…...……………….....…… 22 II.7.1.4. Test d’utilisation du citrate …………………………….…... 22 II.7.1.5. Test d’utilisation d’indole ………………………….…...….. 22 II.7.1.6. Test de catalase ………………………………….………..... 23 II.7.1.7. Test de fluorescence sur King B ……………….…………... 23 II.7.2. Test Biologique ………………………………………………..……... 23 II.7.2.1. Test d’hypersensibilité sur tabac (HR) …………..……….… 23 Chapitre III : Résultats et Interprétations …………………….…...……………………. 24 III.1. Observation des symptômes sur terrain ……………………….……...………. 24 III.2. Résultats du diagnostic au laboratoire ……………………………...…………. 26 III.3. Résultats des tests d’identifications biochimiques ……………...…….………. 27 III.3.1. Test de Gram ………………………………………………..…...…. 27 III.3.2. Test de mise en évidence de l’activité cytochrome oxydase ……....... 27 III.3.3. Test de mise en évidence du métabolisme oxydatif/fermentatif du glucose ………………………………………………………………………. 28 III.3.4. Test d’utilisation du citrate .................................................................. 28 III.3.5. Test d’utilisation d’indole ……………………...……………………. 29 III.3.6. Test de catalase …………………………………...………..………... 30 III.3.7. Test de fluorescence sur King B ……………………...……………... 30 III.4. Test d’identification biologique …………………………………...………...… 31 III.4.1. Test d’hypersensibilité sur tabac (HR) …………………...….……… 31 Chapitre IV. Discussion ...………………………………...………………………………. 34 Conclusion …………………………..……………………………………………………... 37 Références bibliographiques ……………………………………….……………………... 39
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