Isolement et identification des agents responsables de la verticilliose et de la tuberculose de l’olivier dans la wilaya de Bouira.

Boutrik, Sabrine; Fedala, Sarra

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Titre:	Isolement et identification des agents responsables de la verticilliose et de la tuberculose de l’olivier dans la wilaya de Bouira.
Auteur(s):	Boutrik, Sabrine Fedala, Sarra
Mots-clés:	Olivier, Olea europea L, chemlal, tuberculose, verticilliose, Pseudomonas savastanoi Verticillium dahliae , Staphylococcus aureus, Antagonisme , Antibiogramme
Date de publication:	27-jui-2018
Editeur:	Université de Bouira
Référence bibliographique:	Université de Bouira
Résumé:	L’olivier est parmi les plus anciens arbres fruitiers cultivés principalement dans les pays méditerranéens, cet arbre est bien connu pour son intérêt alimentaire et thérapeutique.La tuberculose et la Verticiliiose sont des maladies bactériennes et fongiques affectant les oliviers causés par Pseudomonas savastanoi et Verticillium dahliae, respectivement. L’objectif de notre travail est l’isolement des agents pathogènes qui causent la Verticelliose et la Tuberculose chez l’olivier à partir des organes qui présentent des symptômes caractéristiques de chaque maladie sur les oliviers cultivés dans le verger de la famille Siad située à Maala commune d’Ait Laaziz et le verger Mr Lamouri situé à la commune d’Elhachimia wilaya de Bouira. Les études macroscopique et microscopique réalisées montrent la présence de deux espèces de champignons phytopathogénes : Verticillium dahliae et Alternaria sp. La sensibilité de Verticillium dahliae à l’effet inhibiteur du Staphylococcus aureus est plus importante que la sensibilité d’Alternaria sp. L’isolement et l’identification de Pseudomonas savastanoi ont été réalisés et assurés par des études microscopiques et biochimiques. Le test d’antibiogramme révèle que la souche Pseudomonas savastanoi est hautement sensible à la majorité des antibiotiques testés.
Description:	TABLE DES MATIERES Liste des abréviations Liste des figures Liste des tableaux Résumé Introduction………………………………………………………………………...……..1 Partie I : Synthèse bibliographique Chapitre I : Généralité sur l’olivier I .1. Historique de la culture d’olivier………………...……………………...…………3 I. 2. Classification d’olivier ……………………...……………….…………...………..3 I. 3. Cycle de développement………………..………………………………………….4 I.4. Répartition géographique……..………………………….…..……………………..5 I. 4. 1. Dans le monde………………………………………………………………..5 I. 4. 2. En Algérie………………………………..…………….…………………….6 I. 6.Variétés cultivée en Algérie..............................................................................…...7 Chapitre II : Maladies et ravageurs d’olivier II. 1. Les principaux ravageurs de l’olivier.………...…………………...…………..….8 II. 1. 1. Le psylle de l'olivier (Euphylluraolivina)…………………………………...8 II. 1. 2. Cochenille noire de l’olivier (Saissentiaoleae)…………………….……......…8 II.1.2.1. Dégâts………………………………………..……..………………..….8 II.1.3. La teigne de l’olivier…………...……………………………………..………9 II.1.4. la Mouche de l'olive (Dacusoleae)…………...….………………...…….….10 II.2. Les maladies fongiques d’olivier…..………………………………..….………..10 II.2.1. La fumagine………...………..……………………… ……….…………11 II.2.2. L’oeil de paon (le cycloconium)……..…………………..……………….11 II.2.3. La verticilliose……….…………………………………………..…...….12 II.2.3.1. les symptômes de la maladie .............................................................12 II.2.3.2. Description de l’agent pathogène…………..………….……..……..13 II.2.3.2.1. Morphologie et physiologie………………………….………...13 II.2.3.2.2. La classification de Verticilluimdahliae…………………….……14 II.2.3.2.3.Cycle de développement et le processus d’infection de Verticilliumdahliae……………………………………………………………………………..….15 II.2.3.3. La lutte contre la verticilliose de l’olivier……………………......…16 II.3. Les maladies bactériennes d’olivier……………………………..………...….….17 II.3.1. La bactériose ou La tuberculose de l’olivier………..……………….……...17 II.3.1.1. Les symptômes de la maladie………………………………..……..….17 II.3.1.2. Description de l’agent causal……….….…...………………….…..….18 II.3.1.2.1. Morphologie et physiologie…….………………………...……....18 II.3.1.2.2. Classification de Pseudomonas savastanoi……….……...……….…19 II.3.1.2.3. Cycle de développement de Pseudomonas savastanoi…..….……..19 II.3.1.3. La lute contre la tuberculose de l’olivier…………..…………....…......20 Partie II : Expérimentale Chapitre I : Matériel et méthode I.1.Matériel…………………………………………….………………………………21 I.1.1. Matériel biologique………………….………………………….……………21 I.1.2. Matériels non biologique………………………..……………………….…..21 I.2. Méthode……..…………………………………………………………………….21 I.2.1. Echantillonnage...……………………….………………………….………...21 I.2.2.Isolement et identification………………………...………………..…………23 I.2.2.1.Isolement des souches fongiques………………………………………..23 I.2.2.2.Obtention des isolats fongiques………………………………………….23 I.2.2.3.Observation macroscopique et microscopique…………………………..24 I.2.2.3.1. Observation macroscopique de la culture…………….…...……….24 I.2.2.3.2. Observation microscopique…………….………………..………..24 I.2.2.4.Technique d’antagonisme……………………………….………………24 I.2.3.Isolement des bactéries à partir des tumeurs……………………………….…25 I.2.3.1.Prélèvement des échantillons et macération……………………….…….25 I.2.3.2. Ensemencement………………………………………………….……...26 I.2.3.3.Purification………………………………………………………………26 I.2.3.4.Observation macroscopique et microscopique……….………………….26 I.2.3.4.1. observation macroscopique ...……………………………………..26 I.2.3.4.2.observation microscopique……….………………………… ..……26 I.2.3.4.3.Etude à l’état frais……………………………….………………....26 I.2.3.4.4.Coloration de Gram…………………………….…………..………26 I.2.3.5.Tests biochimiques………………………………………………………27 I.2.3.5.1.Catalase….……………………………………………...…………..27 I.2.3.5.2.Oxydase…….……………………………………………...……….28 I.2.3.5.3. Mannitol mobilité……………………….………..………………..28 I.2.3.6. Le profil de résistance aux antibiotiques……………………………......29 Chapitre II : Résultats et discussion II.1. Isolement et identification…………………………………………..…………....30 II.1.1. identification des espèces fongiques……………………………….………..30 II.1.1.1. Etude macroscopique et microscopique de Verticilluim dahliae..….….35 II.1.1.2. Activité d’antagonisme…...……………………………………...……33 II.1.1.2.1.Confrontation directe sur milieu de culture entre Verticilliumdahliae et Staphylococcus aureur……………………………………………...….33 II.1.1.2.2.Confrontation directe sur milieu de culture entre d’Alternariasp et Staphylococcus aureus…………….…………………………...………………………………35 II.1.2. Isolement des bactéries à partir des tumeurs………….………………….…37 II.1.2.1. Etude des caractères macroscopiques…………..……..………...……..37 II.1.2.2. Etude des caractères microscopiques…………………..………………38 II.1.2.3. Etude des caractères biochimiques……………..………………..…….39 II.1.2.4. l’antibiogramme……………..................................................................41 Conclusion……………………………………………………………………………….42 Références bibliographiques…………………………………...................……...……..43
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Collection(s) :	Mémoires Master

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